Подольская область охватывает водораздельную часть Подольской возвышенности. На севере она имеет хорошо выраженную границу с Малым Полесьем, на юго-западе — с Толтровым кряжем.
Подольская область и ее восточная граница одновременно разделяет Западно-Украинскую и Днестровско-Днепровскую физико-географические провинции. Для Подольской области характерны абсолютные отметки поверхности 300−400 м.
Высоты Кременецкой возвышенности достигают 408 м, максимальная высота Авратинской возвышенности, где берет начало р. Южный Буг, составляет 380 м.
В формировании ландшафтов Подольской области большое значение имеют повсеместно распространенные лессовые породы, которые сравнительно маломощным слоем перекрывают неогеновые и меловые отложения, водно-ледниковые пески и супеси, слагающие проходные долины или образующие отдельные массивы среди лессовых равнин.
В ландшафтной структуре Подольской области преобладали в прошлом лугово-степные и лесостепные природные комплексы с типичными малогумусными и оподзоленными черноземами, в настоящее время практически полностью превращенными в пахотные земли.
В северной части области выделяются структурно-денудационные холмогорные местности с водораздельными останцами, оврагами и балками.
Типичны они для Кременецкого кряжа, расположенного между реками Иква и Вилия. Длина его 65 км, ширина 12−20 км. Вершины кряжа куполообразные, их относительные высоты достигают 100−200 м, они круто обрываются к равнине Малого Полесья, над которым возвышаются горы Замковая, Страховая, Острая, Стожок, Черча, Девичьи скалы и др.
В основании этих гор находится белый мел, на котором залегают глины, кварцевые пески, песчаники, известняки, образующие живописные крутые склоны, скалы с пещерами, уступами, эрозионными формами.
На преобладающих здесь серых почвах произрастают грабово-дубовые леса, а в подлеске — бересклет бородавчатый и европейский, волчеягодник, свидина кроваво-красная, лещина.
Леса занимают 20% площади Кременецкого кряжа. Среди них большую роль играют грабовые леса, сменившие дубово-сосновые, распространенные в восточной части Подольской области на дерново-подзолистых почвах.
Равнинные и равнинно-волнистые местности с типичными малогумусными и оподзоленными черноземами распространены на Авратинской возвышенности, занимают обширные территории на междуречье Случь и Горынь.
Эти местности на 80% и более распаханы, заняты посевами озимой пшеницы, сахарной свеклы, кукурузы, гречихи, ячменя, овощных культур, садами и ягодниками.
На севере Подольской области Украины, возле населенных пунктов Белогорье, Плужное, Грицев, распространены природные комплексы смешанных лесов: на водно-ледниковых супесчаных и песчаных отложениях сформировались дерново-подзолистые почвы. Эти местности занимают до 4% территории области. В поймах рек сформировались луговые, лугово-болотные и болотные местности, занимающие до 9% территории Подольской области.